Уровень центральной власти
Менеджмент в окружающей среде осуществляется главным образом Министерством экологии и чрезвычайных ситуаций (МЭиЧС). Его основной задачей является разработка и проведение государственной политики в области управления охраной окружающей среды и рациональным использованием природных ресурсов. На региональном уровне МЭиЧС имеет территориальные управления. Существуют межрайонные государственные экологические инспекции и местные фонды охраны природы (МФОП). Региональный уровень управления занимает подчиненное положение.
МЭиЧС работает в направлениях, которые связаны со всеми основными направлениями ГЭФ\ПМГ, но главным образом в области Сохранения биоразнообразия.
Министерство сельского, водного хозяйства и перерабатывающей промышленности - осуществляет деятельность, которая связана главным образом с основными направлениями ГЭФ\ПМГ "Международные воды" или с кроссфокальными проблемами, такими как борьба с опустыниванием.
Госагентство по энергетике разрабатывает проекты, имеющие отношение главным образом к двум направлениями ГЭФ\ПМГ "Международные воды" и "Смягчение изменений климата".
Госагентство по регистрации недвижимости и земельных ресурсов разрабатывает проекты связанные с сохранением биоразнообразия, международными водами и кроссфокальными проблемами, такими как деградация земель

Местный уровень
Потенциал органов местного самоуправления в управлении окружающей средой еще практически не начал осваиваться, хотя их полномочия достаточно велики.
Постановлением Правительства от 12.09.00 № 563 органам местной власти делегированы следующие полномочия:
· участие в осуществлении санитарно-эпидемиологического надзора;
· координацию мероприятий по санитарной охране территории от распространения карантинных и других инфекций
· содействие заинтересованным министерствам, государственным комитетам и административным ведомствам в организации и ведении контроля и учета использования вод, взимания платы за услуги по подаче воды из внутрихозяйственных оросительных систем
· подготовку предложений по схемам развития и размещения производительных сил, проектов планировки и застройки территории с учетом факторов, направленных на защиту населения и окружающей среды от чрезвычайных ситуаций;
· внедрение общинного ведения лесного хозяйства;
· проведение на контрактной основе совместно с туристическими организациями мероприятий, направленных на создание условий отдыха и туризма на территории местного сообщества, мероприятий по организации туристических маршрутов в лесных массивах и охотничьих хозяйствах.
· разработку и выполнение региональных экологических программ и мероприятий по охране окружающей среды и рациональному природопользованию.

Местные органы власти могли бы повлиять на решение на местах экологических проблем, таких как: улучшение управления лесными ресурсами, организационные реформы, инвестиции в коммунальную инфраструктуру села: сельское водоснабжение и канализации, переработка и вывоз и размещение твердых бытовых отходов.

Основной деятельностью ГЕФ/ПМГ в Кыргызстане является вовлечение местных общин и организаций гражданского общества в деятельность, адресованную глобальным экологическим проблемам в таких направлениях как сохранение биоразнобразия, смягчение последствий изменения климата, международные воды и деградация земель, которая связана с упомянутыми направлениями. Эта деятельность одновременно порождает местные экологические и экономические выгоды посредством усиления и поощрения роли местных общин, НПО, ОО стимулирует создание и поддержку их сети, устанавливает сотрудничество с другими участниками и заинтересованными сторонами местного и национального уровня.

Долгосрочные цели и задачи
Повышение осведомленности и понимания местными сообществами проблем, связанных с сохранением биоразнобразия, изменением климата, защитой международных вод, и их взаимосвязи с потребностями жизнеобеспечения на местах.
Развитие и поддержка местных общин и НПО/ОО в их инициативах, которые вносят вклад в достижении экологических выгод глобального значения, пропаганда положительных примеров и результатов с целью мобилизации дополнительных ресурсов от других потенциальных национальных и международных доноров.
Создание Национального Фонда ГЭФ\ПМГ, служащего катализатором или связующим элементом для мероприятий, имеющих прочную базу для устойчивости и самообеспечения.
Усиление полномочий и возможностей НПО/ОО, развитие сети неправительственных организаций, воспринимающих деятельность по сокращению глобальных угроз окружающей среде как один из своих приоритетов.
Пропаганда ГЭФ, его полномочий, цели и деятельности, через распространение информации относительно деятельности ГЭФ среди соответствующих организаций и рядовой общественности
Исследование возможностей развития проектов ГЭФ более крупного масштаба, основанных на малых инициативах, предпринятых в рамках ГЭФ/ПМГ, установление взаимосвязи с проектами ГЭФ более крупного масштаба на национальном уровне, а так же сотрудничество с другим национальными и международными программами.

Результат 1: Национальная Стратегия ГЭФ/ПМГ разработана, одобрена, регулярно пересматривается и исполняется
Задача: соответствие Национальной Стратегии с общими требованиями ГЭФ/ПМГ и национальными экологическими приоритетам.

Результат 2: Инновационно- демонстрационные проекты на уровне общин отобраны и осуществлены.
Задача: а) Продемонстрировать обязательство и вклад общины адресованные
проблемам окружающей среды глобального характера
б) Обеспечить соответствие основным направлениям ГЭФ.
в) Обеспечить появление (зарождение) местных выгод экологического и экономического характера на местах.

Результат 3: Координация и взаимодействие ГЭФ/ПМГ с ПРООН, средними и большими проектами ГЭФ, государственными агентствами и другими программами
Задача а) Развитие контактов, сотрудничество и взаимосвязи с другими партнерами и
государственными агентствами
б) Придание большей значимости общинным подходам к проблемам окружающей среды глобального характера внутри ПРООН и других программ доноров

Результат 4: Систематическая и четкая программа для развития потенциала и усиления возможностей основных участников и заинтересованных сторон.
Задача : Развитие потенциала основных участников по оценке потребностей и ресурсов, разработке, реализации и мониторингу собственных проектов в основных направлениях ГЭФ\ПМГ.

Результат 5: Информационный обмен, построение информационной сети, повышение осведомленности об экологическом образовании приобрели организационные формы и действуют.
Задача : а)Пропаганда программы и ее лучших достижений как средство создания интереса различных сторон и доноров к воспроизведению подобной деятельности
Б) обсепечение юридической и социально-экономической устойчивости программы

Результат 6: Мобилизация ресурсов от других доноров и проектов ПРООН как гарантия устойчивости
Задача : Определение дополнительного финансирования для деятельности по развитию и сопутствующим мероприятиям

Результат 7: Система оценки и мониторинга для отслеживании и определении выгод глобального характера на местах
Задача: Развитие системы контроля за вложенными ресурсами, результатами, воздействием